UV-süsteemi ökonoomsus määratakse järgmiste tegurite abil: seadmete maksumus ja eluiga; elektritõhusus; steriliseerimisefekti vähenemise aste töö ajal; elektrikulud jne. Ultraviolett-desinfitseerimissüsteemi majanduslik analüüs pole veel jõudnud järeldusele. Erinevate järeldustega analüüsiaruandeid on palju. On arvamusi, et ultraviolett desinfitseerimisseade tarbib palju elektrit ning seadmete hooldus ja maksumus on kõrged. Suurte süsteemide puhul on investeeringud seadmetesse osoonisüsteemi omast suuremad ja tegevuskulud on sarnased osooni omaga; kuid väikese puhta vee tootmise süsteemi puhul on investeering väiksem kui osooniseadme oma. Samuti on arvamusi, et tuhandetes tonnides päevas või suuremate kaalude puhul on UV-desinfitseerimissüsteemi investeeringu- ja tegevuskulud väga soodsad, mis on palju madalamad kui kloorimise ja osooni desinfitseerimise kulud. Näiteks on olemas analüütilised andmed, et väikese joogiveepuhastusjaama ehitamisel, mille elanike arv jääb vahemikku 10–25 000, on ultraviolett-, kloordioksiidi- ja osooni desinfitseerimiskulude ligikaudne suhe 1: 4: (8–9). elanikkond suurem kui 500 000 ühiskondliku organisatsiooni puhul on kulude suhe umbes 1: 2,5: 2,5.
Need kuluprognoosid ei sisalda desinfitseerimise kõrvalproduktide ja krüptosporiidiumtsüstide eemaldamise lisakulusid, kui kasutatakse mitte-UV-desinfitseerimisprotsesse. Lisaks näitavad analüüsiandmed, et ultraviolett desinfitseerimise investeeringu- ja tegevuskulud on madalamad kui kloori desinfitseerimisel ja desinfitseerimise kulud on umbes pool kloori omadest, kuid erinevus väheneb veepuhastusskaala laienedes.
Prantsusmaal ja endises Nõukogude Liidus piirdus ultraviolett desinfitseerimine väikeste seadmetega. Rajatud suured seadmed pidid ultraviolettlambid järjestikku paigaldama filtreeritud vee torustikku. Ameerika Ühendriikides piirdub ultraviolett desinfitseerimine ka väikeste seadmete ja basseinidega ning seda kombineeritakse sageli teiste desinfektsioonivahenditega. Praktilistes rakendustes on siiski teatatud, et ultraviolett-desinfitseerimist kasutavate joogiveetaimede arv on ületanud 1,5 miljonit tonni päevas.